Trong cải cách thể chế, Sở đã thường xuyên rà soát và kịp thời tham mưu, đề xuất với UBND tỉnh hủy bỏ hoặc sửa đổi bổ sung văn bản quy phạm pháp luật cho phù hợp với thực tiễn và quy định của pháp luật mới ban hành thuộc lĩnh vực của ngành, cụ thể như: Quy định quản lý nhiệm vụ khoa học và công nghệ trên địa bàn tỉnh Cao Bằng; Quy định tuyển chọn, xét chọn tổ chức, cá nhân chủ trì thực hiện đề tài, dự án cấp tỉnh; Quy định đánh giá, nghiệm thu đề tài khoa học và công nghệ cấp tỉnh; Quy định về quản lý an toàn bức xạ trên địa bàn tỉnh Cao Bằng; Chính sách hỗ trợ đầu tư đổi mới công nghệ, nâng cao năng suất chất lượng sản phẩm và xác lập quyền sở hữu công nghiệp trên địa bàn tỉnh…
Việc hiện đại hóa nền hành chính đã tăng cường cơ sở vật chất cho các phòng các đơn vị trực thuộc Sở, tạo điều kiện tốt hơn cho việc thực hiện nhiệm vụ chuyên môn được giao. Ứng dụng công nghệ thông tin trong xử lý công việc, tất cả các văn bản, đi, đến đều được lưu trữ và xử lý trên mạng nội bộ (Eoffice) của Sở, tạo thuận lợi trong giải quyết công việc giữa các phòng, đơn vị trực thuộc Sở.
Tiếp tục phát huy những kết quả đã đạt được,khắc phục những hạn chế, trong thời gian tới, công tác CCHC của Sở tập trung thực hiện một số nhiệm vụ trọng tâm sau:
Tăng cường cơ sở vật chất cho các phòng, các đơn vị trực thuộc Sở. Tiếp tục đẩy mạnh ứng dụng đồng bộ công nghệ thông tin trong công tác quản lý và điều hành các mặt công tác của Sở, đảm bảo các văn bản đi, đến được lưu trữ và xử lý trong nội bộ Sở trên hệ thống văn phòng điện tử.
Nâng cao chất lượng việc tham mưu các văn bản quy phạm pháp luật trong lĩnh vực ngành. Duy trì việc áp dụng hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001:2008 trong hoạt động của Sở. Tham mưu cho UBND tỉnh trong việc chỉ đạo và áp dụng hệ thống quản lý chất lượng ISO cho các cơ quan hành chính của tỉnh theo kế hoạch, đảm bảo chất lượng.
Thực hiện tốt công tác cán bộ, tiếp tục điều động, bố trí sử dụng cán bộ phù hợp với chuyên môn nhằm phát huy tốt đa năng lực của công chức, viên chức.
Gắn trách nhiệm của lãnh đạo các phòng, thủ trưởng các đơn vị trực thuộc trong việc tuyên truyền chủ trương, đường lối chính sách, pháp luật của nhà nước đến công chức viên chức, chấp hành luật phòng chống tham nhũng thực hành tiết kiệm, chống lãng phí, gắn công tác thanh tra, kiểm tra giải quyết khiếu nại, xử lý nghiêm vi phạm
Không ngừng Tăng cường công tác tuyên truyền về CCHC, kịp thời phát hiện phổ biến, nhân rộng các điển hình tiên tiến, biêu dương những tập thể các nhân trong việc phát hiện, phê bình những biểu hiện nhũng nhiễu hách dịch quan liêu…., để tất các cán bộ, công chức viên chức nhận thức đúng và thực hiện nghiêm túc các nội dung về CCHC.